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illumina二代BETVLCTOR伟德在线

更新時間:2022-06-12

簡要描述:

illumina二代BETVLCTOR伟德在线MiSeq係統可通過各種測序應用為(wei) 您的研究提供便利。它能夠自動生成雙端read,每次運行的產(chan) 出高達15 Gb,每條read可提供600多個(ge) 堿基的測序數據。它使用的文庫製備試劑盒已針對多種應用進行了優(you) 化,包括靶向基因測序、小型基因組測序、擴增子測序、16S宏基因組學等。

Illumina公司推出MiSeq是一台在單個(ge) 儀(yi) 器上整合了擴增、測序和數據分析的新款BETVLCTOR伟德在线,每次運行能產(chan) 生超過1Gb的數據,且占地麵積僅(jin) 為(wei) 2平方英尺。MiSeq的流程和準確性,讓它成為(wei) 快速且經濟的遺傳(chuan) 分析的理想平台,適合廣泛的應用。同時Illumina已被FDA大量采購並即將通過FDA認證,12年10月,MiSeq係統的測序通量已升級至8G左右。升級通過兩(liang) 個(ge) 方麵完成,一個(ge) 是cluster密度的增大,升級後cluster密度增加至15-17million,而pair-end讀取的reads數目將會(hui) 增加至30-34million;另一方麵是通過測序讀長而提升通量,測序讀長達到2*300bp,同時測序速度也有所提升。目前,Broad研究院已經利用現有試劑實現了單端測序300bp讀長,Illumina目前內(nei) 部測序更是完成了2*400bp的pair-end測序。而這些,都是保證在高質量數據結果的前提下完成的。


MiSeq性能參數


Illumina MiSeq測序時間和數據量


讀長(bp)時間總數據量Q30
1×36~4 hrs540-610 Mb﹥90%
2×25~5.5 hrs750-850 Mb﹥90%
2×100~16.5 hrs3.0-3.4 Gb﹥85%
2×150~24 hrs4.5-5.1 Gb﹥80%
2×250~39 hrs7.5-8.5 Gb﹥70%



Illumina MiSeq讀取量比對


運行類型通過過濾的讀取(百萬)
升級前升級後
單端讀取5-7 M15-17 M
末端配對讀取10-14 M30-34 M


工作流程


illumina二代BETVLCTOR伟德在线 MiSeq四大特性

1、較短的實驗周期:從(cong) 樣品製備開始需要8小時即可得到超過100M的高質量測序結果。

2、便捷的樣品製備流程:需50ngDNA模板,2小時的自動化操作就可以完成全部樣品製備工作。

3、測序原理:MiSeq繼續GA和HiSeq平台的邊合成邊測序的化學原理。

4、完整的整合功能:MiSeq可以獨立完成簇生成,雙向測序及數據分析工作,讓經費和實驗室空間不再成為(wei) NGS研究的障礙。


illumina二代BETVLCTOR伟德在线 MiSeq應用範圍

1、轉錄組測序

派森諾MiSeq測序平台是基因組已測序物種的轉錄組分析平台。公司技術團隊目前已完成了包括斑馬魚在內(nei) 的多種植物、動物的轉錄組測序及分析。


2、宏基因組16S rDNA單V區測序

對16s rDNA的單V區(V3\V4)進行高通量測序,鑒定細菌群和古生菌群。派森諾的技術團隊使用Illumina MiSeq測序16S rDNA V4區並結合Roche 454 FLX+測序16S rDNA V1~V3區成功的對雞的腸道環境細菌進行了鑒定。


3、Small RNA測序

1*35bp的讀長配合了小RNA的測序長度,速度快,靈敏度高。派森諾的技術團隊目前已完成了鵝的小RNA測序和多種中草藥的小RNA測序。


4、重測序:包括全基因組重測序、簡化基因組測序、外顯子測序。

Illumina MiSeq非常適用於(yu) 對微生物基因組的重測序,每次運行即可完成一個(ge) 微生物基因組測序。2011年12月27日,派森諾的技術團隊利用MiSeq一次運行同時完成了乳酸菌(Lactobacillus casei Zhang和Lactobacillus casei P8)的重測序,基因組覆蓋深度為(wei) 分別為(wei) 404倍和213倍,比對至參考序列,基因組實現全覆蓋,同時檢測到了多種結構變異,包括插入、缺失和SNP位點,並且檢測到了全部質粒。


數據展示

* 以上產(chan) 品介紹及數據來源於(yu) Illumina,僅(jin) 供參考,以Illumina為(wei) 準。



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